基因表達(dá)譜芯片可使科研工作者實(shí)現(xiàn)在mRNA水平上同時(shí)平行研究成百上千乃至上萬條基因的表達(dá)關(guān)系。它與傳統(tǒng)的研究基因表達(dá)的方法（如差異cDNA文庫篩選、Northern blot和PCR）相比較，可為使用者節(jié)省大量的研究經(jīng)費(fèi)和時(shí)間， 并獲得范圍更廣、更具有關(guān)聯(lián)性的研究結(jié)果。它的主要用途是用于大規(guī)模分析一定的生物對象在特定生物過程中（如疾病、發(fā)育、分化、凋亡等）基因表達(dá)變化的全面信息。目前已經(jīng)廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)檢測、基因功能研究、新基因識別、藥物靶點(diǎn)篩選、藥物作用機(jī)理和毒理、疾病相關(guān)基因和生物標(biāo)記物等眾多研究領(lǐng)域。

SBC可為客戶提供Affymetrix、Agilent、Illumina等基因表達(dá)譜芯片服務(wù)。

服務(wù)推薦

芯片名稱		芯片介紹
人表達(dá)譜芯片服務(wù)	Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Array	此款芯片包含了47,000個(gè)轉(zhuǎn)錄本，代表了38,500個(gè)明晰的人類基因。數(shù)據(jù)庫來源于GeneBank、dbEST、RefSeq、 UniGene database(Build 159 January 25 2003)、 Washington University EST trace repository、 NCBI human genome assembly(Build 31)。
	Affymetrix GeneChip Human Transcriptome Array 2.0 NEW!	最高分辨率的基因芯片，支持所有轉(zhuǎn)錄本異構(gòu)體的全轉(zhuǎn)錄組分析，包含超過六百萬條不同探針，覆蓋編碼和非編碼轉(zhuǎn)錄本。 該芯片為每個(gè)外顯子設(shè)計(jì)約10條探針，每個(gè)外顯子之間的剪接點(diǎn)有4條探針，確保每個(gè)實(shí)驗(yàn)都能獲得完整、準(zhǔn)確和可重復(fù)的數(shù)據(jù)。重復(fù)性高（批內(nèi)相關(guān)系數(shù)≥0.99），所有檢測過的組織觀察到的變異系數(shù)（CV）<6.5%。樣品類型既包括新鮮凍存樣品，也包括FFPE 樣本。
	Affymetrix GeneChip PrimeViewTMHuman Gene Expression Array	新版人3’ IVT表達(dá)譜卡式芯片，利用GeneChip® Scanner 3000 7G system平臺，據(jù)2011年6月份的數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)，覆蓋人類基因組中確認(rèn)的注解明晰的20000多個(gè)基因的36000多個(gè)轉(zhuǎn)錄本，具有超強(qiáng)靈敏度和高度的可重復(fù)性，低CV值，完全覆蓋帶注解基因組。
	Affymetrix GeneChip Human Gene 2.0ST Array	Affymetrix新一代全轉(zhuǎn)錄本芯片，在一張芯片上可以同時(shí)檢測mRNA和lincRNA，在其上一代1.0 ST Array的基礎(chǔ)上，該芯片內(nèi)容進(jìn)一步豐富并更新數(shù)據(jù)庫。2.0 ST Array有更多的優(yōu)點(diǎn)：全面覆蓋轉(zhuǎn)錄組，可以同時(shí)檢測>30,000個(gè)編碼的轉(zhuǎn)錄本和>11,000個(gè)長鏈非編碼轉(zhuǎn)錄本；探針設(shè)計(jì)最大程度覆蓋所有外顯子，可檢測選擇性拼接/轉(zhuǎn)錄本變體。每個(gè)轉(zhuǎn)錄本覆蓋特異探針的數(shù)目中值達(dá)到21種，每種探針的長度為25bp，這意味著每個(gè)轉(zhuǎn)錄本將被檢測的堿基數(shù)中值高達(dá)525個(gè)；重復(fù)性高；靈敏度高。
	Agilent Whole Human Genome Oligo Microarray 4×44K Kit	Agilent 的人全基因組表達(dá)譜芯片匯總目前所了解的人類全基因組序列信息，代表了超過41,000人類基因和轉(zhuǎn)錄本。設(shè)計(jì)該產(chǎn)品所用的序列信息源于對 RefSeq、Goldenpath、Ensembl和Unigene 等知名數(shù)據(jù)庫的深入研究，并與人類基因組拼接進(jìn)行比對。絕大多數(shù)探針經(jīng)過 Agilent專利的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證程序的檢驗(yàn)和優(yōu)化。
	Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K v2 Microarray Kit	新一代的安捷倫人類表達(dá)譜芯片，包含了最新公布的人類lincRNA以及TUCP目錄，據(jù)RefSeq數(shù)據(jù)庫更新了mRNA，其探針覆蓋49,000個(gè)轉(zhuǎn)錄本。
	Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K Kit	安捷倫人類表達(dá)譜芯片，基于G3平臺。除了涵蓋27,958條Entrez Gene RNAs外，更涵蓋7,419條lincRNA。不僅能檢測蛋白編碼RNA表達(dá)量的變化，也能檢測非編碼RNA的表達(dá)量變化。探針設(shè)計(jì)參照的數(shù)據(jù)庫為：RefSeq Build 36.3；Ensemble Release 52；Unigene Build 216；GenBank (April 2009)。非編碼RNA探針是和John Rinn 實(shí)驗(yàn)室（隸屬于麻省理工學(xué)院-哈佛大學(xué)博德研究所）共同設(shè)計(jì)的。
	Illumina HumanHT-12 v4 Expression BeadChip	該全基因組表達(dá)譜芯片包括超過47,000個(gè)探針，覆蓋31,000多個(gè)注釋基因，可同時(shí)檢測12個(gè)樣本。信息來源RefSeq 數(shù)據(jù)庫 ( Release38)，UniGene 數(shù)據(jù)庫 (Build 199)。
小鼠表達(dá)譜芯片服務(wù)	Affymetrix GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array	Affymetrix 小鼠基因組430 2.0芯片涵蓋了39,000個(gè)轉(zhuǎn)錄本，代表34,000個(gè)明晰的小鼠基因。序列信息基于GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database。
	Affymetrix GeneChipMouse Transcriptome Assay 1.0 NEW!	最高分辨率的小鼠基因芯片，支持所有轉(zhuǎn)錄本異構(gòu)體的全轉(zhuǎn)錄組分析，覆蓋超過23,000個(gè)編碼基因(其中包括超過114,000個(gè)轉(zhuǎn)錄本; 332,000個(gè)外顯子以及215,000個(gè)外顯子簇)和超過55,000個(gè)非編碼基因（其中包括101,000個(gè)轉(zhuǎn)錄本; 222,000個(gè)外顯子以及162,000個(gè)外顯子簇）。該芯片為每個(gè)外顯子設(shè)計(jì)約10條探針，每個(gè)外顯子之間的剪接點(diǎn)有4條探針，確保每個(gè)實(shí)驗(yàn)都能獲得完整、準(zhǔn)確和可重復(fù)的數(shù)據(jù)。重復(fù)性高，批內(nèi)相關(guān)系數(shù)≥0.99。樣品類型既包括新鮮凍存樣品，也包括FFPE 樣本。這種芯片的應(yīng)用將加快人類疾病的臨床前研究，提高了從小鼠模型研究轉(zhuǎn)化到人類疾病研究的成功率。
	Affymetrix GeneChip Mouse Gene 2.0 ST Array	小鼠全轉(zhuǎn)錄本芯片，在一張芯片上可以同時(shí)檢測mRNA和lincRNA，可同時(shí)檢測>35,000個(gè)編碼的和非編碼的轉(zhuǎn)錄本及>2,000個(gè)長鏈基因間非編碼轉(zhuǎn)錄本
	Agilent Whole Mouse Genome Oligo Microarray, 4×44K	Agilent 小鼠全基因組表達(dá)譜芯片真正代表小鼠基因組中所有已知基因及其產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本，代表了超過 41,174 個(gè)小鼠基因和轉(zhuǎn)錄本。設(shè)計(jì)該產(chǎn)品所用的序列信息源于對 UCSC、NIA、RefSeq、Ensembl、Unigene和RIKEN等知名數(shù)據(jù)庫的深入研究，而且絕大多數(shù)探針經(jīng)過Agilent專利的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證程序的檢驗(yàn)和優(yōu)化。
	Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K Kit	安捷倫最新設(shè)計(jì)的小鼠表達(dá)譜芯片，基于G3平臺。除了涵蓋39,430條Entrez Gene RNAs外，更涵蓋16,251條lincRNA。不僅能檢測蛋白編碼RNA表達(dá)量的變化，也能檢測非編碼RNA的表達(dá)量變化。探針設(shè)計(jì)參照的數(shù)據(jù)庫為：RefSeq Build 37；Ensembl Release 55；Unigene Build 176；GenBank (April 2009)；RIKEN 3。
	Illumina MouseRef-8 v2 Expression BeadChip	該全基因組表達(dá)譜芯片包括約25,600個(gè)轉(zhuǎn)錄本, 參考數(shù)據(jù)庫為：NCBI RefSeq（Build 36, Release 22）。
	Illumina MouseWG-6 v2 Expression BeadChip	該全基因組表達(dá)譜芯片包括約45,200個(gè)轉(zhuǎn)錄本，參考數(shù)據(jù)庫為：NCBI RefSeq（Build 36, Release 22）；RIKEN FANTOM2；MEEBO。
大鼠表達(dá)譜芯片服務(wù)	Affymetrix GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array	Affymetrix 大鼠基因組230 2.0芯片包含有31,000個(gè)probe sets，代表28,000個(gè)明晰的大鼠基因。序列信息基于GenBank , dbEST, RefSeq等權(quán)威數(shù)據(jù)庫。
	Affymetrix GeneChip Rat Gene 2.0 ST Array	大鼠全轉(zhuǎn)錄本芯片，在一張芯片上可以同時(shí)檢測mRNA和lincRNA，可同時(shí)檢測>27,000個(gè)蛋白編碼轉(zhuǎn)錄本及>23,500個(gè)  Entrez基因
	Agilent Whole Rat Genome Oligo Microarray, 4×44K	Agilent 大鼠全基因組表達(dá)譜芯片真正代表大鼠基因組中所有已知基因及其產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本，代表了超過 41,012 個(gè)大鼠基因和轉(zhuǎn)錄本。設(shè)計(jì)該產(chǎn)品所用的序列信息源于對 RefSeq、Ensembl、Unigene 和GenBank等知名數(shù)據(jù)庫的深入研究，而且絕大多數(shù)探針經(jīng)過Agilent專利的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證程序的檢驗(yàn)和優(yōu)化。
	Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8x60K Kit	安捷倫最新設(shè)計(jì)的大鼠表達(dá)譜芯片，基于G3平臺。涵蓋30,003條Entrez Gene RNAs。探針設(shè)計(jì)參照的數(shù)據(jù)庫為：RefSeq Build 36.2；Ensembl Release 55；Unigene Build 177；GenBank (January 2009)。

SBC提供其它物種的表達(dá)譜芯片

Affymetrix 3' IVT Expression Array: 擬南芥、苜蓿、稻、大豆、大麥、小麥、柑橘、棉花、玉米、白楊、甘蔗、西紅柿、葡萄、酵母、果蠅、秀麗隱桿線蟲、牛、犬、雞、豬、恒河猴、非洲爪蟾、熱帶爪蟾、斑馬魚。

Affymetrix Gene 1.0 ST Array : 擬南芥、苜蓿、稻、大豆、果蠅、秀麗隱桿線蟲、牛、犬、雞、豬、恒河獼猴、食蟹獼猴、馬、貓、豚鼠、狨猴、羊、兔、恒河猴、斑胸草雀、斑馬魚、番茄。

Agilent 3' IVT Expression Array：擬南芥、苜蓿、稻、大麥、棉花、蕓苔屬植物、煙草、西紅柿、小麥、酵母、大腸桿菌、稻瘟菌、果蠅、秀麗隱桿線蟲、蚊子、牛、犬、雞、豬、馬、恒河猴、兔、三文魚、羊、非洲爪蟾、斑馬魚。

FFPE樣品的表達(dá)譜芯片服務(wù)
芯片推薦：Illumina Human Whole-Genome DASL HT Assay BeadChip
芯片介紹：Human Whole-Genome DASL（cDNA介導(dǎo)的退火、選擇、延伸和連接）Assay是唯一一個(gè)能從低豐度或部分降解的人RNA樣本中產(chǎn)生全基因組表達(dá)圖譜的優(yōu)化整合系統(tǒng)，特別適用于那些來自甲醛固定石蠟包埋（FFPE）組織的RNA樣本。芯片覆蓋約29,000個(gè)轉(zhuǎn)錄本。信息來源RefSeq 數(shù)據(jù)庫 (Build 36.2, Release 38)。

芯片推薦：Affymetrix Almac XcelTM Array
芯片介紹：Almac XcelTM芯片是目前市場上唯一一款為福爾馬林石蠟包埋(FFPE)樣本設(shè)計(jì)和優(yōu)化的3' 端表達(dá)譜芯片。芯片包含了針對97,000多個(gè)轉(zhuǎn)錄本的探針組，其中許多是其他芯片沒有的。芯片約70%內(nèi)容與GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 芯片的內(nèi)容相同。還有8%是U133 plus 2.0芯片未包含的經(jīng)過驗(yàn)證的RefSeq更新信息，其余22%來自高質(zhì)量的Almac公司內(nèi)部測序數(shù)據(jù)和驗(yàn)證過濾后的公開數(shù)據(jù)。 
Affymetrix GeneChip Human Transcriptome 2.0 Array和Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Array這兩款芯片在我們已經(jīng)服務(wù)過的FFPE樣品表達(dá)譜檢測應(yīng)用中也同樣表現(xiàn)優(yōu)異。

單位介紹

•        上海伯豪生物技術(shù)有限公司（Shanghai Biotechnology Corporation）是上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心根據(jù)國內(nèi)外研發(fā)外包發(fā)展的需要，整合旗下系統(tǒng)技術(shù)平臺、商業(yè)化服務(wù)體系、高素質(zhì)服務(wù)團(tuán)隊(duì)等資源成立的致力于研發(fā)外包服務(wù)的專業(yè)化公司。

  上海伯豪生物技術(shù)有限公司擁有六大服務(wù)平臺：生物樣品分析平臺、微陣列芯片平臺、新一代測序平臺、生物標(biāo)志物平臺、分子檢測平臺、生物信息平臺，憑借高標(biāo)準(zhǔn)的技術(shù)平臺和多樣化的服務(wù)等競爭優(yōu)勢，公司向國內(nèi)外企業(yè)和相關(guān)單位提供系統(tǒng)的生物學(xué)研究全面解決方案。目前正在為多達(dá)18家跨國制藥企業(yè)（包括排名前10位的跨國制藥企業(yè)）和超過3000家的國內(nèi)科研機(jī)構(gòu)、醫(yī)院等提供基因表達(dá)譜、基因分型、比較基因組學(xué)、DNA甲基化、miRNA、生物標(biāo)志物篩選及確認(rèn)、生物信息等技術(shù)服務(wù)。 

  公司擁有一支以上海為基礎(chǔ)，輻射全國的強(qiáng)大市場營銷隊(duì)伍和銷售網(wǎng)絡(luò)，已設(shè)立華北、華南、華東三個(gè)大區(qū)十五個(gè)辦事處，推廣公司的主導(dǎo)技術(shù)服務(wù)、代理產(chǎn)品，快速提升公司品牌的知名度，擴(kuò)大影響力。過去10年承接項(xiàng)目數(shù)超過10000個(gè)，用戶單位3000家以上，協(xié)助客戶發(fā)表SCI論文700余篇（影響因子共計(jì)3000多分），全面推動(dòng)了中國基因組學(xué)服務(wù)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。 

  公司建立了規(guī)?；馁|(zhì)量控制體系，通過了ISO9001: 2008質(zhì)量技術(shù)體系的認(rèn)證，并參照GLP-L的標(biāo)準(zhǔn)，通過128個(gè)SOP文件對項(xiàng)目、樣品、實(shí)驗(yàn)過程、生物信息分析過程、數(shù)據(jù)信息管理、保密等進(jìn)行嚴(yán)格質(zhì)控。尤其是數(shù)據(jù)管理，做到異地備份，保密管理。為用戶的數(shù)據(jù)真實(shí)性、可靠性提供了保證。

  公司的系統(tǒng)化技術(shù)平臺和高質(zhì)量的服務(wù)體系得到了廣大客戶認(rèn)可和合作伙伴的高度評價(jià)。公司平臺陸續(xù)獲得了國際知名高通量技術(shù)廠商Illumina、Affymetrix、Agilent、ABI的技術(shù)服務(wù)中心認(rèn)證。公司于2012年獲得諾華（CNIBR）優(yōu)秀供應(yīng)商獎(jiǎng)（Supplier Award 2012）。公司是Affymetrix公司在中國第一家認(rèn)證的服務(wù)提供商，是Agilent公司在國內(nèi)唯一認(rèn)證的服務(wù)提供商，先后被授予“Agilent公司亞太區(qū)最佳服務(wù)供應(yīng)商”和“Affymetrix公司優(yōu)秀服務(wù)商”稱號。

  
  

單位資質(zhì)

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