目標(biāo)區(qū)域捕獲測序是利用特制的探針對(duì)客戶感興趣的基因組區(qū)域進(jìn)行富集后再進(jìn)行測序的研究方法。通過該方法能夠獲得特定區(qū)域的遺傳信息,極大地提高了基因組中特定區(qū)域的研究效率,顯著降低了研究成本。從而幫助廣大科研工作者篩選變異位點(diǎn)、識(shí)別和研究與疾病、種群進(jìn)化相關(guān)的編碼區(qū)域內(nèi)的結(jié)構(gòu)變異。您只需提供樣本和候選區(qū)域,上海伯豪即可為您提供從探針定制、雜交、測序到生物信息分析的全面解決方案。
一、基于AmpliSeqTM 技術(shù)的序列捕獲解決方案
Ampliseq捕獲系統(tǒng) + Ion Torrent PGM測序平臺(tái)
Ion Torrent是最新一代的測序技術(shù),它的問世給測序技術(shù)的應(yīng)用帶來了激動(dòng)人心的進(jìn)展。它采用了半導(dǎo)體技術(shù)和簡單的化學(xué)試劑進(jìn)行DNA測序,而不是使用光作為媒介。在半導(dǎo)體芯片的微孔中固定DNA鏈,隨后依次摻入ATCG。隨著每個(gè)堿基的摻入,釋放出氫離子,在它們穿過每個(gè)孔底部時(shí)能被檢測到,通過對(duì)H+的檢測,實(shí)時(shí)判讀堿基。
序列捕獲測序能對(duì)基因組上某些特定的區(qū)域進(jìn)行分析,但是傳統(tǒng)的序列捕獲測序技術(shù)操作復(fù)雜,實(shí)驗(yàn)時(shí)間長,且對(duì)DNA樣品的數(shù)量要求較高。結(jié)合Ion Torrent測序儀, AmpliSeqTM技術(shù)通過超高多重PCR,只需低起始量樣品,能夠在一管中同時(shí)擴(kuò)增幾千種PCR片段,科學(xué)家們能夠快速完成某些疾病相關(guān)基因的突變篩察。同時(shí),本系統(tǒng)可還可以為有需要的科學(xué)家定制目標(biāo)序列的多重PCR體系,快速完成檢測流程。
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二、基于Agilent HaloPlex技術(shù)的序列捕獲解決方案
HaloPlex 技術(shù)完美融合了聚合酶鏈反應(yīng)系統(tǒng)的速度和特異性以及基于液相雜交體系的可擴(kuò)展性和捕獲片段大小的靈活性(捕獲區(qū)域大小為1Kb-5Mb,推薦<500Kb區(qū)段設(shè)計(jì))。該實(shí)驗(yàn)方案無需文庫構(gòu)建,利用單管操作,從而解決了多重 PCR 由于存在交叉雜交問題而使靶向序列數(shù)量受限的問題。
除了客戶自己定制序列,HaloPlex還針對(duì)特定的疾病提供設(shè)計(jì)好的解決方案,目前有以下幾種,如果研究者需要研究其他疾病,可以通過SureDesign來查看。
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三、基于Agilent SureSelect技術(shù)的序列捕獲解決方案
Agilent SureSelect定制捕獲可針對(duì)基因組的一小部分區(qū)段進(jìn)行探針設(shè)計(jì),從而大大降低測序及分析流程的復(fù)雜性。靈活的設(shè)計(jì)方式以及與各種高通量測序平臺(tái)良好的對(duì)接能力,使得Agilent SureSelect定制捕獲能夠有效地滿足科學(xué)家的各種定制要求。
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四、基于NimbleGen技術(shù)的序列捕獲解決方案
NimbleGen SeqCap捕獲系統(tǒng)采用advanced repeat masking方法設(shè)計(jì)探針,并在此基礎(chǔ)上,利用實(shí)際測序數(shù)據(jù)再次進(jìn)行平衡篩選,保證了很好的均一性(uniformity)和覆蓋率(coverage),可以有效捕捉到每個(gè)靶向序列,從而對(duì)目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行精確細(xì)致的分析,有效監(jiān)測SNP突變。SeqCap可使用多至2.1M數(shù)量的探針進(jìn)行捕獲設(shè)計(jì),產(chǎn)生可靠數(shù)據(jù),降低成本,節(jié)約時(shí)間。
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上海伯豪生物技術(shù)有限公司擁有六大服務(wù)平臺(tái):生物樣品分析平臺(tái)、微陣列芯片平臺(tái)、新一代測序平臺(tái)、生物標(biāo)志物平臺(tái)、分子檢測平臺(tái)、生物信息平臺(tái),憑借高標(biāo)準(zhǔn)的技術(shù)平臺(tái)和多樣化的服務(wù)等競爭優(yōu)勢,公司向國內(nèi)外企業(yè)和相關(guān)單位提供系統(tǒng)的生物學(xué)研究全面解決方案。目前正在為多達(dá)18家跨國制藥企業(yè)(包括排名前10位的跨國制藥企業(yè))和超過3000家的國內(nèi)科研機(jī)構(gòu)、醫(yī)院等提供基因表達(dá)譜、基因分型、比較基因組學(xué)、DNA甲基化、miRNA、生物標(biāo)志物篩選及確認(rèn)、生物信息等技術(shù)服務(wù)。
公司擁有一支以上海為基礎(chǔ),輻射全國的強(qiáng)大市場營銷隊(duì)伍和銷售網(wǎng)絡(luò),已設(shè)立華北、華南、華東三個(gè)大區(qū)十五個(gè)辦事處,推廣公司的主導(dǎo)技術(shù)服務(wù)、代理產(chǎn)品,快速提升公司品牌的知名度,擴(kuò)大影響力。過去10年承接項(xiàng)目數(shù)超過10000個(gè),用戶單位3000家以上,協(xié)助客戶發(fā)表SCI論文700余篇(影響因子共計(jì)3000多分),全面推動(dòng)了中國基因組學(xué)服務(wù)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。
公司建立了規(guī)?;馁|(zhì)量控制體系,通過了ISO9001: 2008質(zhì)量技術(shù)體系的認(rèn)證,并參照GLP-L的標(biāo)準(zhǔn),通過128個(gè)SOP文件對(duì)項(xiàng)目、樣品、實(shí)驗(yàn)過程、生物信息分析過程、數(shù)據(jù)信息管理、保密等進(jìn)行嚴(yán)格質(zhì)控。尤其是數(shù)據(jù)管理,做到異地備份,保密管理。為用戶的數(shù)據(jù)真實(shí)性、可靠性提供了保證。
公司的系統(tǒng)化技術(shù)平臺(tái)和高質(zhì)量的服務(wù)體系得到了廣大客戶認(rèn)可和合作伙伴的高度評(píng)價(jià)。公司平臺(tái)陸續(xù)獲得了國際知名高通量技術(shù)廠商Illumina、Affymetrix、Agilent、ABI的技術(shù)服務(wù)中心認(rèn)證。公司于2012年獲得諾華(CNIBR)優(yōu)秀供應(yīng)商獎(jiǎng)(Supplier Award 2012)。公司是Affymetrix公司在中國第一家認(rèn)證的服務(wù)提供商,是Agilent公司在國內(nèi)唯一認(rèn)證的服務(wù)提供商,先后被授予“Agilent公司亞太區(qū)最佳服務(wù)供應(yīng)商”和“Affymetrix公司優(yōu)秀服務(wù)商”稱號(hào)。
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上海伯豪生物技術(shù)有限公司擁有六大服務(wù)平臺(tái):生物樣品分析平臺(tái)、微陣列芯片平臺(tái)、新一代測序平臺(tái)、生物標(biāo)志物平臺(tái)、分子檢測平臺(tái)、生物信息平臺(tái),憑借高標(biāo)準(zhǔn)的技術(shù)平臺(tái)和多樣化的服務(wù)等競爭優(yōu)勢,公司向國內(nèi)外企業(yè)和相關(guān)單位提供系統(tǒng)的生物學(xué)研究全面解決方案。目前正在為多達(dá)18家跨國制藥企業(yè)(包括排名前10位的跨國制藥企業(yè))和超過3000家的國內(nèi)科研機(jī)構(gòu)、醫(yī)院等提供基因表達(dá)譜、基因分型、比較基因組學(xué)、DNA甲基化、miRNA、生物標(biāo)志物篩選及確認(rèn)、生物信息等技術(shù)服務(wù)。
公司擁有一支以上海為基礎(chǔ),輻射全國的強(qiáng)大市場營銷隊(duì)伍和銷售網(wǎng)絡(luò),已設(shè)立華北、華南、華東三個(gè)大區(qū)十五個(gè)辦事處,推廣公司的主導(dǎo)技術(shù)服務(wù)、代理產(chǎn)品,快速提升公司品牌的知名度,擴(kuò)大影響力。過去10年承接項(xiàng)目數(shù)超過10000個(gè),用戶單位3000家以上,協(xié)助客戶發(fā)表SCI論文700余篇(影響因子共計(jì)3000多分),全面推動(dòng)了中國基因組學(xué)服務(wù)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。
公司建立了規(guī)?;馁|(zhì)量控制體系,通過了ISO9001: 2008質(zhì)量技術(shù)體系的認(rèn)證,并參照GLP-L的標(biāo)準(zhǔn),通過128個(gè)SOP文件對(duì)項(xiàng)目、樣品、實(shí)驗(yàn)過程、生物信息分析過程、數(shù)據(jù)信息管理、保密等進(jìn)行嚴(yán)格質(zhì)控。尤其是數(shù)據(jù)管理,做到異地備份,保密管理。為用戶的數(shù)據(jù)真實(shí)性、可靠性提供了保證。
公司的系統(tǒng)化技術(shù)平臺(tái)和高質(zhì)量的服務(wù)體系得到了廣大客戶認(rèn)可和合作伙伴的高度評(píng)價(jià)。公司平臺(tái)陸續(xù)獲得了國際知名高通量技術(shù)廠商Illumina、Affymetrix、Agilent、ABI的技術(shù)服務(wù)中心認(rèn)證。公司于2012年獲得諾華(CNIBR)優(yōu)秀供應(yīng)商獎(jiǎng)(Supplier Award 2012)。公司是Affymetrix公司在中國第一家認(rèn)證的服務(wù)提供商,是Agilent公司在國內(nèi)唯一認(rèn)證的服務(wù)提供商,先后被授予“Agilent公司亞太區(qū)最佳服務(wù)供應(yīng)商”和“Affymetrix公司優(yōu)秀服務(wù)商”稱號(hào)。
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