lncRNA與microRNA的靶點(diǎn)驗(yàn)證
lncRNA的作用機(jī)制有很多,以ceRNA(competing endogenous RNA,競(jìng)爭(zhēng)性的內(nèi)源RNA)形式發(fā)揮功能是其中的一種,即lncRNA與靶基因的3’UTR競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合相同的microRNA,降低microRNA對(duì)靶基因的抑制功能,從而上調(diào)靶基因的表達(dá)量。為了檢測(cè)其效果,我們可以用Western Blot檢測(cè)靶蛋白的表達(dá)水平,也可以用qRT-PCR檢測(cè)靶基因的表達(dá)。但是這兩種方式都無法確定lncRNA是否通過ceRNA方式調(diào)控靶基因的表達(dá)。因此,我們可以通過“microRNA與lncRNA結(jié)合驗(yàn)證”,“microRNA與靶基因結(jié)合驗(yàn)證”和“lncRNA與靶基因3’UTR競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合microRNA驗(yàn)證”實(shí)驗(yàn),構(gòu)建Sensor reporter并進(jìn)行活性檢測(cè),對(duì)lncRNA,microRNA與靶基因這三者間的作用機(jī)制作出準(zhǔn)確判斷。
服務(wù)優(yōu)勢(shì):
(1)利用專業(yè)軟件進(jìn)行miRNA與lncRNA和靶基因3’UTR區(qū)的結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè);
(2)采用Promega公司特有psiCHECK質(zhì)粒;
(3)所采用的Luciferase雙熒光報(bào)告系統(tǒng),可以獲得寬泛的線性定量范圍與極高的靈敏度;
(4)采用瞬時(shí)轉(zhuǎn)染技術(shù),操作簡(jiǎn)便、快速,周期短,適用于絕大多數(shù)細(xì)胞類型。
服務(wù)流程:
一、microRNA與lncRNA結(jié)合驗(yàn)證
(1)直接合成靶lncRNA序列或microRNA在靶lncRNA上的結(jié)合位點(diǎn)序列;
(2)將上述合成的DNA片段克隆至報(bào)告基因載體psiCHECK質(zhì)粒;
(3)購買microRNA mimics;
(4)將報(bào)告載體與microRNA mimics共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞;
(5)多功能酶標(biāo)儀檢測(cè)報(bào)告基因的表達(dá)水平;
(6)數(shù)據(jù)分析,整理提交客戶原始數(shù)據(jù)及項(xiàng)目報(bào)告;
注:為了實(shí)驗(yàn)的嚴(yán)謹(jǐn)性,可加入靶lncRNA序列中microRNA預(yù)測(cè)結(jié)合區(qū)域的突變體作為對(duì)照,進(jìn)一步說明問題。
二、microRNA與靶基因結(jié)合驗(yàn)證
(1)直接合成靶基因3’UTR序列或microRNA在靶基因3’UTR上的結(jié)合位點(diǎn)序列;
(2)將上述合成的DNA片段克隆至報(bào)告基因載體psiCHECK質(zhì)粒;
(3)購買microRNA mimics;
(4)將報(bào)告載體與microRNA mimics共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞;
(5)多功能酶標(biāo)儀檢測(cè)報(bào)告基因的表達(dá)水平;
(6)數(shù)據(jù)分析,整理提交客戶原始數(shù)據(jù)及項(xiàng)目報(bào)告;
注:為了實(shí)驗(yàn)的嚴(yán)謹(jǐn)性,可加入靶基因3’UTR區(qū)microRNA預(yù)測(cè)結(jié)合區(qū)域的突變體作為對(duì)照,進(jìn)一步說明問題。
三、lncRNA與靶基因3’UTR競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合microRNA驗(yàn)證
(1)直接合成靶基因3’UTR序列或microRNA在靶基因3’UTR上的結(jié)合位點(diǎn)序列;
(2)將上述合成的DNA片段克隆至報(bào)告基因載體psiCHECK質(zhì)粒;
(3)直接合成lncRNA序列,構(gòu)建lncRNA過表達(dá)質(zhì)粒;
(4)將報(bào)告載體與lncRNA表達(dá)載體共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞;
(5)多功能酶標(biāo)儀檢測(cè)報(bào)告基因的表達(dá)水平;
(6)數(shù)據(jù)分析,整理提交客戶原始數(shù)據(jù)及項(xiàng)目報(bào)告;
注:為了實(shí)驗(yàn)的嚴(yán)謹(jǐn)性,可加入靶基因3’UTR區(qū)microRNA預(yù)測(cè)結(jié)合區(qū)域的突變型報(bào)告載體及lncRNA序列中microRNA預(yù)測(cè)結(jié)合區(qū)域的突變型表達(dá)載體作為對(duì)照,進(jìn)一步說明問題。
漢恒生物科技(上海)有限公司是國內(nèi)首家專業(yè)從事腺相關(guān)病毒(AAV)載體研究和開發(fā)的公司,成立于2010年。擁有一支由博士和碩士為主50多人的優(yōu)秀研發(fā)團(tuán)隊(duì),擁有全面的AAV血清型體系,完善的AAV光遺傳原件庫,快速表達(dá)的scAAV體系和AAV衍生的在體應(yīng)用工具,開發(fā)了自噬流研究工具、分子載體探針、Crispr基因編輯等基因及信號(hào)通路研究工具,積累了上千個(gè)病毒項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),是國內(nèi)唯一一家擁有AAV-saCas9在體編輯工具和AAV-LC3在體自噬流檢測(cè)工具的公司。公司建立了ISO9001質(zhì)量管理體系,擁有發(fā)明專利1項(xiàng),申請(qǐng)發(fā)明專利5項(xiàng)。
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漢恒生物科技(上海)有限公司是國內(nèi)首家專業(yè)從事腺相關(guān)病毒(AAV)載體研究和開發(fā)的公司,成立于2010年。擁有一支由博士和碩士為主50多人的優(yōu)秀研發(fā)團(tuán)隊(duì),擁有全面的AAV血清型體系,完善的AAV光遺傳原件庫,快速表達(dá)的scAAV體系和AAV衍生的在體應(yīng)用工具,開發(fā)了自噬流研究工具、分子載體探針、Crispr基因編輯等基因及信號(hào)通路研究工具,積累了上千個(gè)病毒項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),是國內(nèi)唯一一家擁有AAV-saCas9在體編輯工具和AAV-LC3在體自噬流檢測(cè)工具的公司。公司建立了ISO9001質(zhì)量管理體系,擁有發(fā)明專利1項(xiàng),申請(qǐng)發(fā)明專利5項(xiàng)。
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