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2020生物數(shù)據(jù)分析技能2.0實(shí)訓(xùn)會(總第22期,1月合肥班)

  • 開始時(shí)間:2020年01月10日 08時(shí)00分
  • 培訓(xùn)地點(diǎn):合肥市瑤海區(qū)北二環(huán)雙七路156號
  • 報(bào)名費(fèi)用:3400

1已報(bào)名

  • 技術(shù)領(lǐng)域:生物技術(shù)
  • 適應(yīng)對象:業(yè)內(nèi)專業(yè)人士
  • 培訓(xùn)介紹
  • 成效與資料

    課程簡介

    • 課程類型:技術(shù)培訓(xùn)
    • 報(bào)名時(shí)間:2019年12月20日 00時(shí)00分- 2020年01月09日 17時(shí)00分
    • 報(bào)名方式:在線報(bào)名
    • 限制人數(shù):50(單位:人)
    • 課程形式:培訓(xùn)會

    課程內(nèi)容

       課程介紹

      課程介紹 主辦方介紹


      2020生物數(shù)據(jù)分析技能2.0實(shí)訓(xùn)會(總第22期,1月合肥班)

      2020生物數(shù)據(jù)分析技能2.0實(shí)訓(xùn)會(總第22期,1月合肥班)宣傳圖

      生物醫(yī)學(xué)已進(jìn)入大數(shù)據(jù)時(shí)代,借助生物醫(yī)學(xué)多組學(xué)、多層次的海量數(shù)據(jù),可以從前所未有的廣度和深度來研究生物體運(yùn)行機(jī)制。由于生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)多呈分散復(fù)雜特征,以海量數(shù)據(jù)挖掘與分析為主體內(nèi)容的生物信息學(xué)技能就成為科研必要手段,如疾病的病因?qū)W、臨床診斷標(biāo)志物、治療或作用靶點(diǎn)識別,關(guān)鍵大分子的發(fā)現(xiàn)與功能預(yù)測,以及遺傳調(diào)控機(jī)制等方面。本課程曾先后用名《基因序列分析技術(shù)》和《功能基因組信息分析技術(shù)》,后將上述兩門課程整合更名為《生物數(shù)據(jù)分析技能》,此前共計(jì)舉辦了21期。自本期會議起,會議升級為《生物數(shù)據(jù)分析技能2.0》,對課程內(nèi)容與培訓(xùn)日程進(jìn)行了大幅度調(diào)整,遞進(jìn)式專注講解高通量數(shù)據(jù)解析:表達(dá)數(shù)據(jù)挖掘→共表達(dá)(聚類、富集、相互作用)分析→構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò),以順應(yīng)學(xué)科發(fā)展和滿足學(xué)員實(shí)際需要。授課繼續(xù)沿用主講教師獨(dú)創(chuàng)的TPS(Teaching-Practicing-Showing)教學(xué)模式,著力于以真實(shí)問題為引線,將理論授課與上機(jī)實(shí)踐有機(jī)地融為一體,逐步介紹涉及的各項(xiàng)技能,指導(dǎo)學(xué)員將其融會貫通并應(yīng)用到課題研究中。TPS教學(xué)模式多年來在本科、研究生教學(xué)及20余期各類培訓(xùn)會議中取得了極佳的教學(xué)效果,受到廣大學(xué)員的一致好評和推崇。

      時(shí)間地點(diǎn):

      2020年1月10日-12日(周五-周日)(周五報(bào)到,周六-周日授課兩天一夜)

      合肥伯爵世家酒店(合肥市瑤海區(qū)北二環(huán)雙七路156號)

      主辦單位:

      北京華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司

      培訓(xùn)日程


      培訓(xùn)日程(所有課程均含上機(jī)實(shí)踐)

      日期

      時(shí)間

      授課題目授課內(nèi)容
      1月10日           

      16:00-21:00

      培訓(xùn)簽到-領(lǐng)取資料
      1月11日

      08:00-08:30                   

      軟件安裝,調(diào)試運(yùn)行                       

      08:30-10:30

      表達(dá)譜差異數(shù)據(jù)挖掘
      • 差異表達(dá)基因集(DEGs)分析策略。
      • GEO數(shù)據(jù)庫檢索及數(shù)據(jù)集在線分析。
      • 利用GEO2R在線工具篩選獲得差異表達(dá)基因集,并獲得TCGA數(shù)據(jù)庫交集結(jié)果。

      10:30-12:00

      表達(dá)譜數(shù)據(jù)聚類分析

      • 利用ArrayTools軟件(設(shè)置各項(xiàng)參數(shù))處理GEO數(shù)據(jù)庫下載的表達(dá)譜數(shù)據(jù)。
      • 表達(dá)譜數(shù)據(jù)聚類分析。
      • 聚類圖形優(yōu)化工具。

      14:00-17:30

      基因集功能富集分析
      • 利用DAVID、Metascape在線工具進(jìn)行基因集功能富集分析(GO MF、GO BP、GO CC;KEGG Pathway)。
      • 繪制或下載基因集功能富集圖。
      • 基因集韋恩圖分析。
      • 基因集ID多元轉(zhuǎn)換。
      19:00-22:00基因集相互作用分析
      • 利用String在線工具(設(shè)置各項(xiàng)參數(shù))獲得基因集相互作用結(jié)果。
      • mRNA-miRNA、miRNA-lncRNA、miRNA-circRNA、mRNA-circRNA相互作用分析。
      1月12日

      08:30-12:00

      交互作用數(shù)據(jù)可視化
      • 利用Cytoscape軟件進(jìn)行基因注釋、分子間相互作用、基因集差異表達(dá)的可視化分析。
      • 批量修改交互網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點(diǎn)、邊、背景屬性。
      • 利用Cytoscape App進(jìn)行基因集交互網(wǎng)絡(luò)的GO富集分析、文本挖掘、關(guān)鍵/瓶頸基因及核心基因篩選。
      • 高分辨率可視化結(jié)果的保存與輸出。

      13:30-16:00

      共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
      • 構(gòu)建基因集差異共表達(dá)Pathway/circRNA-mRNA-miRNA-lncRNA/circRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
      • 靶點(diǎn)基因分析策略。

       會議嘉賓


      即將更新,敬請期待

      會議費(fèi)用

      會議費(fèi)用


      會議費(fèi)用:

      2019年12月20日前報(bào)名并繳費(fèi)3200元/人,12月20日后3400元/人(5人及以上團(tuán)體報(bào)名并實(shí)際報(bào)到另優(yōu)惠300元/人),授課期間發(fā)放紙質(zhì)邀請函(蓋章)和發(fā)票。
      本次會議費(fèi)委托合肥華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司收取并統(tǒng)一提供會務(wù)發(fā)票。

      具體事宜:

      1. 培訓(xùn)期間提供午餐、11日晚餐。住宿統(tǒng)一安排在合肥伯爵世家酒店(合肥站店),主辦單位可為學(xué)員代訂房間,標(biāo)準(zhǔn)間/單人間200元/間(含早餐),費(fèi)用自理;學(xué)員也可自行上網(wǎng)預(yù)訂。住宿費(fèi)發(fā)票在退房時(shí)由酒店開具。對于需要合住的學(xué)員,會務(wù)組將按報(bào)到先后順序安排,最后出現(xiàn)單人無法安排的情況,需要自補(bǔ)房間差價(jià)。

      2. 上機(jī)實(shí)踐需自帶筆記本電腦(非上網(wǎng)本),會場將布置充足的電源插座。請確保電腦配置無線網(wǎng)卡(無線wifi覆蓋會場)。為提高上網(wǎng)效率,推薦自行攜帶4G無線上網(wǎng)卡或具有熱點(diǎn)共享功能的手機(jī)。操作系統(tǒng)為Win7/8/10 64位專業(yè)版(非任何商業(yè)版及Mac系統(tǒng)),辦公軟件為Office 2010以上專業(yè)版(非任何商業(yè)版及WPS Office),否則無法保證全部軟件順利安裝和使用。

      3. 授課幻燈、軟件(附安裝指南)及上機(jī)實(shí)踐文檔已上傳至百度網(wǎng)盤,在報(bào)到通知中會告知鏈接及密碼。軟件請事先下載并安裝,如安裝有問題,請咨詢客服或開課當(dāng)天到會場咨詢。

      4. 嚴(yán)格按照培訓(xùn)日程授課(共計(jì)22標(biāo)準(zhǔn)學(xué)時(shí)),第二天16:00結(jié)課,方便外地學(xué)員返程。

    注意事項(xiàng)


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